Всё зависит от характера ошибки. Если допущена техническая опечатка, которая не искажает сути (например, ошибка в корпусе здания или транслитерации названия, но ИНН, КПП, номер и дата верны), — ФНС чаще всего не оспаривает вычет по НДС.
Тем не менее, для снижения рисков рекомендую запросить исправленный счет-фактуру или составить служебную записку, поясняющую расхождение, и сохранить её вместе с документом.
Если ошибка значительная (например, неверный ИНН, чужая организация) — принимать к учету нельзя, документ юридически считается недействительным.
